Dedykowane oprogramowanie do tworzenia i odzyskiwania kopii zapasowych z serwerów Windows podłączonych do urządzeń Ctera. Ctera Backup Agent Server współpracuje z systemami operacyjnymi Windows Server 2008, 2012 i nowszych i działa jako tzw. proces. Poza archiwizacją wszelkich plików czy katalogów użytkowników możliwe jest wykonanie kopii bezpieczeństwa oraz odzyskanie danych dla: Microsoft SQL Server, Microsoft Exchange, Microsoft Share Point, Microsoft Active Directory, Microsoft System State.
Administrator może odzyskiwać dane w dowolnej chwili poprzez aplikację Ctera Backup Agent lub z poziomu serwera Ctera po zalogowaniu się swoim indywidualnym loginem i hasłem na dostępny serwer. Instalacja aplikacji Ctera Server Agent wykonywana jest na każdym serwerze (urucomienie instalatora i podanie adresu IP serwera Ctera w sieci. Z poziomu serwera Ctera (np. Ctera C400) możemy zarządzać wszystkimi Agentami zainstalowanymi na serwerach. Widzimy które serwery są aktualnie podłączone, czy wykonuje się obecnie jakaś kopia, kiedy była wykonana ostatnia kopia itp.